Po určitej dobe používania skenera môže prach z papiera a miestnosti na valci alebo na sklenenej časti vo vnútri skenera spôsobovať problémy s podávaním papiera alebo kvalitou naskenovaného obrazu. Vyčistite vnútro skenera po každých 5,000 skenovaní.
Ak je povrch znečistený ťažko odstrániteľným materiálom, použite na odstránenie škvŕn čistiacu súpravu Epson. Pomocou malého množstva čistiaceho prostriedku na čistiacej handričke odstráňte škvrny.
Na čistenie skenera nikdy nepoužívajte alkohol, riedidlo ani iný korozívny roztok. Môže dôjsť k deformácii alebo zblednutiu farieb.
Nikdy nestriekajte žiadnu tekutinu ani mazivo na skener. Pri poškodení zariadenia alebo obvodov môže dôjsť k nezvyčajným činnostiam.
Nikdy neotvárajte kryt skenera.
Stlačením tlačidla 
vypnite skener.
Odpojte sieťový napájací adaptér od skenera.
Potiahnite páčku a otvorte kryt skenera.
Utrite všetky škvrny na plastovom valci (4 miesta) a sklenenom povrchu na spodnej strane vnútra skenera. Utrite mäkkou handričkou bez chĺpkov navlhčenou malým množstvom čistiaceho prostriedku alebo vodou.
Na sklenený povrch netlačte príliš silno.
Nepoužívajte kefu ani tvrdé nástroje. Akékoľvek poškriabanie skla môže ovplyvniť kvalitu skenovania.
Čistiaci prostriedok nestriekajte priamo na sklenený povrch.
Vatovou tyčinkou utrite všetky škvrny na snímačoch.
Na vatovej tyčinke nepoužívajte žiadne tekutiny, napríklad čistiace prostriedky.
Otvorte kryt a potom vytiahnite oddeľovací valec.
Utrite oddeľovací valec. Utrite mäkkou handričkou bez chĺpkov navlhčenou malým množstvom čistiaceho prostriedku alebo vodou.
Na čistenie valca používajte iba originálnu čistiacu súpravu Epson alebo mäkkú navlhčenú handričku. Suchou handričkou by ste mohli poškodiť povrch valca.
Otvorte kryt a potom vytiahnite podávací valec.
Utrite podávací valec. Utrite mäkkou handričkou bez chĺpkov navlhčenou malým množstvom čistiaceho prostriedku alebo vodou.
Na čistenie valca používajte iba originálnu čistiacu súpravu Epson alebo mäkkú navlhčenú handričku. Suchou handričkou by ste mohli poškodiť povrch valca.
Zatvorte kryt skenera.
Zapojte sieťový napájací adaptér a potom zapnite skener.
Na hlavnej obrazovke vyberte položku Údržba skenera.
Na obrazovke Údržba skenera vyberte možnosť Čistenie valčekov.
Potiahnutím páčky otvorte kryt skenera.
Skener prejde do režimu čistenia valcov.
Pomaly otáčajte valcami za spodok klepnutím kdekoľvek na lCD obrazovke. Utrite valce pomocou originálnej čistiacej súpravy Epson alebo mäkkou a vodou navlhčenou handričkou. Opakujte, kým nebudú valce čisté.
Pri činnosti valca si dávajte pozor na zachytenie rúk alebo vlasov do mechanizmu. Mohlo by dôjsť k úrazu.
Zatvorte kryt skenera.
Skener ukončí režim čistenia valcov.